| B.応用 |
| | B.1 数理・知識表現 |
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| | B.1.1.数理的表現 | 主成分分析、ニューラルネット、HMM、SVM、ベイジアンネットワーク、等 |
| B.1.2.知識の表現と抽出 | 自然言語処理、オントロジー、XML、オブジェクト指向、テキストマイニング、等 |
| B.2 ゲノム解析 |
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| B.2.1.配列解析 | 配列アラインメント、データベースサーチ(FASTA、BLAST)、等 |
| B.2.2.遺伝子解析 | 遺伝子発見、アノテーション、比較ゲノム解析、進化系統樹、等 |
| B.2.3.遺伝子発現データ解析 | クラスタリング、ネットワーク推定、等 |
| B.2.4.ゲノム遺伝解析、ゲノム医科学 | SNP解析、ハプロタイプ解析、ファーマコジェノミクス、個人化医療、等 |
| B.3 タンパク質構造・プロテオーム解析 |
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| B.3.1.タンパク質構造 | 構造決定(X線、NMR)、構造分類、構造予測、ホモロジーモデリング、等 |
| B.3.2.プロテオーム解析 | 2次元電気泳動、質量分析、相互作用解析、等 |
| B.3.3.計算化学 | 量子化学計算、分子動力学計算、構造活性相関、分子ドッキング、等 |
| B.4 関連知識 |
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| B.4.1.細胞内ネットワーク | 代謝ネットワーク、転写制御ネットワーク、シグナル伝達ネットワーク、等 |
| B.4.2.システム生物学 | 反応速度論、細胞シミュレーション、複雑系、等 |
| B.4.3.システム医科学 | 代謝動態シミュレーション、薬物動態シミュレーション、臓器モデリング、等 |